<br><br><div class="gmail_quote">On Sun, Sep 6, 2009 at 8:54 PM, Ross Moore <span dir="ltr"><<a href="mailto:ross@ics.mq.edu.au">ross@ics.mq.edu.au</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">
 <br>
Ergo, abort, kill the .aux  file and try again.<br>
<br>
Of course you may still need to fix whatever it was that<br>
caused the .aux  to get corrupted.<br>
The 1st run after killing the  .aux  probably succeeds,<br>
but with messages about unresolved references, etc.<br>
It'll be the 2nd run of LaTeX where you'll find out whether<br>
the problem has been fixed or not.<div class="im"><br></div></blockquote><div><br></div><div><br></div><div>I am not sure what TeXShop does as asked to remove .aux files in two following situations and I am too lazy to check:</div>
<div><br></div><div>1) One runs master.tex with</div><div><br></div><div>\includeonly{parttwo}</div><div><br></div><div>in preamble and with</div><div><br></div><div>\include{partone}</div><div>\include{partwo}</div><div>
<br></div><div>in the body. Would it kill master.aux and parttwo.aux only or it will kill also partone.aux ? </div><div>If I recall correctly  it would leave partone.aux intact so one would not need to comment out \includeonly and reconstruct partone.aux</div>
<div><br></div><div>2) Some packages create other .aux like files (.toc, .nav, ... ) and I am not sure if those are removed as well</div><div><br></div><div>BTW, one almost sure way to run in this problem is to add or comment out  \usepackage{hyperref} as with or without hyperref .aux files look different.  </div>
<div><br></div><div>Victor</div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div> </div></div><br>-- <br>========================<br>Victor Ivrii, Professor, Department of Mathematics, University of Toronto<br><a href="http://www.math.toronto.edu/ivrii">http://www.math.toronto.edu/ivrii</a><br>